辨别方法一：看杆茎
牡丹的茎为木质，落叶之后，有一部分是不会枯萎的，芍药的茎是草质的，落叶会后地上部分就枯萎了。这是二者的本质区别，一个草本一个木本，一看茎就知道。
辨别方法二：看花型
牡丹的花都是独朵顶生，花型大；而芍药的花则一朵或数多顶生，花型比较小。
辨别方法三：看叶子
牡丹叶子表面绿色中略带黄色，无毛，下面有粉末状东西；芍药叶子表面有浓绿色且叶子比较密。
辨别方法四：看花开期
牡丹在3月开花，芍药则在春末夏初开花，也可以从开花期判断哪个是牡丹哪个是芍药。